RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 DHFRP00374 187 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 KRASP01116 189 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 C15orf32Q32M92 178 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR5B3Q8NH48 314 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 SEC22AQ96IW7 307 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TP53RKQ96S44 253 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 FAM223BA6NKX1 122 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CYB5BO43169 146 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 NDUFB6O95139 128 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CDS2O95674 445 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 G6PCP35575 357 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 AKR1C2P52895 323 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 FAM209BQ5JX69 171 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 NECAP1Q8NC96 275 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR4A16Q8NH70 328 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 C15orf61A6NNL5 157 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 LYRM1O43325 122 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR2C1O95371 312 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR5AC1P0C628 307 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 PSMB6P28072 239 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM56Q96MV1 263 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 RCHY1Q96PM5 261 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 IGKV1-39P01597 117 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 IGKV1D-39P04432 117 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CRYGCP07315 174 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 AKR1C4P17516 323 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CTRB1P17538 263 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR2B8PP59922 312 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TATDN3Q17R31 274 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 LGI3Q8N145 548 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM230Q96A57 120 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CCDC140Q96MF4 163 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 UPK1BO75841 260 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 P0C879 139 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 ASAH1Q13510 395 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM187Q14656 261 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 SP6Q3SY56 376 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 NSG2Q9Y328 171 aa9.85□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 A0A0B4J2A0 478 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 ZNF785A8K8V0 405 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G10O15496 165 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CCR6P51684 374 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 DEFA1P59665 94 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 DEFA3P59666 94 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 KLK9Q2XQG4 91 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 LRTM2Q8N967 370 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 THYN1Q9P016 225 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.84□□□□□ -0.83
HPS1-211ENST00000478087 TENM2Q9NT68 2774 aa9.83□□□□□ -0.84
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.83□□□□□ -0.84
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