RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13C7P0DN81 318 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TBPP20226 339 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 UCP1P25874 307 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 BAK1Q16611 211 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF429Q86V71 674 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N1Y9 231 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 NECAP1Q8NC96 275 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 BORCS5Q969J3 196 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 HINT2Q9BX68 163 aa5.32□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EIM0 57 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ST8SIA3O43173 380 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-48P01763 117 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 GP9P14770 177 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZP3P21754 424 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 INSL3P51460 131 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVK-16P61578 105 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPEL1Q2QD12 228 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 PYDC2Q56P42 97 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR146Q96CH1 333 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ASCL2Q99929 193 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SRRQ9GZT4 340 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA60Q9H7X0 242 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 COPZ2Q9P299 210 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N402 240 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2C3Q8N628 320 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4C12Q96R67 309 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 PRNDQ9UKY0 176 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 AGRNO00468 2067 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T8A6NH00 312 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf70A6NJV1 201 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 I3L2K1 104 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 NXPH3O95157 252 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR183P32249 361 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ADMP35318 185 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL3P36405 182 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV6P41212 452 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM16LQ309B1 348 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1-206ENST00000461017 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5B3Q8NH48 314 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4A16Q8NH70 328 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 B9D2Q9BPU9 175 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
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