RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 MOB3BQ86TA1 216 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR4A5Q8NH83 315 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR9G1Q8NH87 305 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 NIT2Q9NQR4 276 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 A0A087X0M5 115 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GX30 115 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PPQ1 181 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 IFITM10A6NMD0 228 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CD99P14209 185 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 S100A2P29034 98 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ZNF137PP52743 207 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CASP6P55212 293 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 DLX6P56179 175 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 GAMTQ14353 236 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SLC35E1Q96K37 410 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 A0A1W2PN81 502 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CHRNA7P36544 502 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CD69Q07108 199 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FUT9Q9Y231 359 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 DLL1O00548 723 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FOXH1O75593 365 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ACTL6BO94805 426 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR2T10Q8NGZ9 312 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR10J1P30954 320 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 OR4X1Q8NH49 305 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 E7EUB6 86 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 PLAUP00749 431 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 SOD3P08294 240 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 IL3RAP26951 378 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 MC5RP33032 325 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 LINC01560Q8TB33 94 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 UHRF2Q96PU4 802 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-202ENST00000398743 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 IGLV2-23P01705 113 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 C1QTNF9P0C862 333 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 CA7P43166 264 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 MLANAQ16655 118 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 PNKDQ8N490 385 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 ZNF114Q8NC26 417 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 SFRP2Q96HF1 295 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 PSG5Q15238 335 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 MUC15Q8N387 334 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 C11orf52Q96A22 123 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 SPTBN2O15020 2390 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 TYMSP04818 313 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 FABP1P07148 127 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 OR5G3P0C626 314 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 AREGP15514 252 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-202ENST00000398743 UCNP55089 124 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms