RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf61A6NNL5 157 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 PSG2P11465 335 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 IFITM3Q01628 133 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 EXPH5Q8NEV8 1989 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 B9A039 149 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf97H3BN30 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BKO60814 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 IL18BPO95998 194 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 IGHG4P01861 327 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BJP06899 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BOP23527 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BBP33778 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CAMPP49913 170 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BDP58876 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BCP62807 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ID3Q02535 119 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE2BQ13066 116 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE2EQ4V326 116 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 MED29Q9NX70 200 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 F2RL2O00254 374 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZG16O60844 167 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFB8O95169 186 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01590Q5TEZ4 76 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 PATE3B3GLJ2 98 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CCL4P13236 92 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 GLRXP35754 106 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ICAM4Q14773 271 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf83Q53S99 150 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM86BQ8N661 226 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 RAX2Q96IS3 184 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 EMC6Q9BV81 110 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 LTBP2Q14767 1821 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CCL21O00585 134 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 APOMO95445 188 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TIMP3P35625 211 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CX3CL1P78423 397 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 RNF152Q8N8N0 203 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JMM0 328 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPB8 328 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 KIR3DP1A8MWS1 328 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 FOXH1O75593 365 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO17Q96EF6 278 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 DSCR9P59020 149 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TCF19Q9Y242 345 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 COL4A1P02462 1669 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 EFEMP2O95967 443 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 RUNX1Q01196 453 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 NABP2Q9BQ15 211 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 COLCA2A8K830 154 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf80F5H4A9 247 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CFHR1Q03591 330 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.15□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms