RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 DPF1Q92782 380 aa11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PRRT1Q99946 306 aa11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 C15orf61A6NNL5 157 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OVOL1O14753 267 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 NDUFB8O95169 186 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TRBV12-3P01733 135 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 S100A5P33763 92 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 INSL3P51460 131 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PPP5CP53041 499 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 ERVK-16P61578 105 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 DEFA5Q01523 94 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 AARDQ4LEZ3 155 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 ZNF429Q86V71 674 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 Q8N402 240 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR5B3Q8NH48 314 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TMEM230Q96A57 120 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PRNDQ9UKY0 176 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 NSG2Q9Y328 171 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TGP01266 2768 aa11.88□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 A0A0B4J293 547 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 A6NHS1 94 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 K7EIL1 84 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SERPINE2P07093 398 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 MFAP2P55001 183 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 ATP5G2Q06055 141 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 GALNT14Q96FL9 552 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TSC22D3Q99576 134 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.87□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 BMPR1BO00238 502 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR2J3O76001 311 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 ZP3P21754 424 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 BAK1Q16611 211 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 C15orf32Q32M92 178 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SP6Q3SY56 376 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PYDC2Q56P42 97 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 Q6ZRM9 215 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TMEM56Q96MV1 263 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 COPZ2Q9P299 210 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.86□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 A0A0G2JRQ6 117 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SNAPC5O75971 98 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 RAB25P57735 213 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 DHODHQ02127 395 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 FAM209BQ5JX69 171 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 CCDC140Q96MF4 163 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 NAA60Q9H7X0 242 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.85□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 REG1AP05451 166 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR5AC1P0C628 307 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 OR13C7P0DN81 318 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TMEM187Q14656 261 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
BECN1-211ENST00000589636 SORL1Q92673 2214 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 DHFRP00374 187 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 AP3S2P59780 193 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 PRCDQ00LT1 54 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 GPHB5Q86YW7 130 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 OR2C3Q8N628 320 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZNF114Q8NC26 417 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.83□□□□□ -0.52
BECN1-211ENST00000589636 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms