RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR10W1Q8NGF6 305 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR1L8Q8NGR8 309 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 FANCD2OSQ96PS1 177 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TSC22D3Q99576 134 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 PRNDQ9UKY0 176 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DBX1A6NMT0 343 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 C15orf61A6NNL5 157 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DHFRP00374 187 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TRAPPC2P0DI81 140 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TRAPPC2BP0DI82 140 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 C15orf32Q32M92 178 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SP6Q3SY56 376 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 HINT2Q9BX68 163 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM14BQ9NUH8 114 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 GPR132Q9UNW8 380 aa16.09■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DEFA4P12838 97 aa16.08■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 ZP3P21754 424 aa16.08■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 AP3S2P59780 193 aa16.08■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM16LQ309B1 348 aa16.08■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.08■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.08■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 IGKV1-5P01602 117 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 UCP1P25874 307 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 WT1-ASQ06250 92 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 KLK9Q2XQG4 91 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 OR5B3Q8NH48 314 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 SRRQ9GZT4 340 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 NAA60Q9H7X0 242 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.07■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 B3GALNT1O75752 331 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 NDUFB8O95169 186 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 OR5AC1P0C628 307 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 OR13C7P0DN81 318 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 AKR1C2P52895 323 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 OR4A16Q8NH70 328 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM222Q9H0R3 208 aa16.06■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 P0C879 139 aa16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 ACSM6Q6P461 480 aa16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 MRAPQ8TCY5 172 aa16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 S4R3C0 116 aa16.05■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 BMPR1BO00238 502 aa16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 SAP30O75446 220 aa16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 ATG12O94817 140 aa16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 INSL3P51460 131 aa16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.04■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 K7EIL1 84 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 IGHV3-23P01764 117 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 SYNJ2BPP57105 145 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 RPEL1Q2QD12 228 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF429Q86V71 674 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM230Q96A57 120 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC140Q96MF4 163 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM56Q96MV1 263 aa16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0B4J293 547 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0G2JRQ6 117 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 CDS2O95674 445 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 FAM209BQ5JX69 171 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 LHFPL5Q8TAF8 219 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TMOD3-203ENST00000558455 PPP5D1E7EU14 171 aa16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-203ENST00000558455 MFAP2P55001 183 aa16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-203ENST00000558455 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-203ENST00000558455 PRCDQ00LT1 54 aa16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-203ENST00000558455 DHODHQ02127 395 aa16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-203ENST00000558455 BAK1Q16611 211 aa16.01■□□□□ 0.15
TMOD3-203ENST00000558455 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.8 ms