RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ZP3	P21754	424 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ETV6	P41212	452 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	NECAP1	Q8NC96	275 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	THYN1	Q9P016	225 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ANXA3	P12429	323 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CTRB1	P17538	263 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	DHODH	Q02127	395 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	C15orf32	Q32M92	178 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CADM3	Q8N126	398 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	DCUN1D4	Q92564	292 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CRYGC	P07315	174 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	AKR1C4	P17516	323 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	UCP1	P25874	307 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF45	Q02386	682 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	VWF	P04275	2813 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059		A0A1B0GW64	132 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CENPX	A8MT69	81 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SAP30	O75446	220 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IFNA17	P01571	189 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SLC35G3	Q8N808	338 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	INSL3	P51460	131 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	NDUFB8	O95169	186 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	LY86	O95711	162 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	VAMP1	P23763	118 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	SRPX	P78539	464 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	PRCD	Q00LT1	54 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	WT1-AS	Q06250	92 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	BAK1	Q16611	211 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CHID1-222	ENST00000533059	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.65	□□□□□ -0.7

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