RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	FOLR2	P14207	255 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	S100G	P29377	79 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DDT	P30046	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	MARCKSL1	P49006	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PSPH	P78330	225 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	TFF3	Q07654	80 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	BAMBI	Q13145	260 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	BATF	Q16520	125 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	FAM78B	Q5VT40	261 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	CGB2	Q6NT52	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ARL9	Q6T311	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	RPRML	Q8N4K4	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	C12orf57	Q99622	126 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	GINS3	Q9BRX5	216 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	FAM60A	Q9NP50	221 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF225	Q9UK10	706 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	HSPB11	Q9Y547	144 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	CUBN	O60494	3623 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	HBZ	P02008	142 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SERPINA7	P05543	415 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PRTN3	P24158	256 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	CD34	P28906	385 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	MEOX2	P50222	304 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	MAX	P61244	160 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DAD1	P61803	113 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF45	Q02386	682 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PAX8	Q06710	450 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	NSDHL	Q15738	373 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF404	Q494X3	552 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	OPN5	Q6U736	354 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF550	Q7Z398	422 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SLC35F6	Q8N357	371 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	BORCS7	Q96B45	105 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF649	Q9BS31	505 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJC13	O75165	2243 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PPR1	153 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	C5orf49	A4QMS7	147 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	TLCD2	A6NGC4	264 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	FAAH	O00519	579 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC22	O60826	627 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	ZBTB25	P24278	435 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	RAB13	P51153	203 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	HERVK_113	P61574	105 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PRDX4	Q13162	271 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PCM1-223	ENST00000524356	PNOC	Q13519	176 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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