RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR13C9Q8NGT0 318 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR11L1Q8NGX0 322 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 NT5C3BQ969T7 300 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 ISOC2Q96AB3 205 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OPTNQ96CV9 577 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUP58Q9BVL2 599 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRRG3Q9BZD7 231 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 BLZF1Q9H2G9 400 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 FBXL15Q9H469 300 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TIMM22Q9Y584 194 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 H0YAA0 97 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 H0YCG3 227 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 GMDSO60547 372 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPAG6O75602 509 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TFPTP0C1Z6 253 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LIPCP11150 499 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 AKR1C4P17516 323 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR10J1P30954 320 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CA7P43166 264 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSR2P43308 183 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 HAAOP46952 286 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SULT1A2P50226 295 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB38P57729 211 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC35B1P78383 322 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAD51Q06609 339 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 BAXQ07812 192 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 STX5Q13190 355 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4D1Q15615 310 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LCN15Q6UWW0 184 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM122BQ7Z309 247 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC34Q8IZ02 419 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OFCC1Q8IZS5 231 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 PACRGLQ8N7B6 248 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5K1Q8NHB7 308 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 NRGNQ92686 78 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 MUCL1Q96DR8 90 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 PKIBQ9C010 78 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LPAR5Q9H1C0 372 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR54Q9H977 334 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM216Q9P0N5 145 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00527Q9UJ94 153 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSPB8Q9UJY1 196 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPRASP1Q5JY77 1395 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCN3AQ9NY46 2000 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHD5Q8TDI0 1954 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCL16O15467 120 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYTH3O43739 400 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LYZL6O75951 148 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBL3O95164 117 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SULT1A3P0DMM9 295 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SULT1A4P0DMN0 295 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC74AQ0VAA2 488 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL24Q13007 206 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPM6BQ13491 265 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 C4orf26Q17RF5 130 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPINK13Q1W4C9 94 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALKBH6Q3KRA9 238 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 DUPD1Q68J44 220 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSX9Q7RTT3 188 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2W3Q7Z3T1 314 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAM1L1Q8N609 369 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TET1Q8NFU7 2136 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 C11orf40Q8WZ69 217 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR7D2Q96RA2 312 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCL19Q99731 98 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2AG1Q9H205 316 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR51B6Q9H340 312 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSTPIP2Q9H939 334 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 XAGE1AQ9HD64 81 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 C14orf105Q9NVL8 296 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAT2BQ9NZL9 334 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 COQ4Q9Y3A0 265 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 RTL1A6NKG5 1358 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 NINLQ9Y2I6 1382 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEC14L6B5MCN3 397 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCL1BO95988 128 aa-1.15□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms