RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ACTL6B	O94805	426 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CCR6	P51684	374 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CADM3	Q8N126	398 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	NAA60	Q9H7X0	242 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	LINC01619	G3V211	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	BMPR1B	O00238	502 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	PLA2G10	O15496	165 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM187	Q14656	261 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	PRRT1	Q99946	306 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487		K7EIL1	84 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CDS2	O95674	445 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	IL7	P13232	177 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ERVK-16	P61578	105 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TG	P01266	2768 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SERPINE2	P07093	398 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	OVOL1	O14753	267 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	FGF2	P09038	288 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	AKR1C4	P17516	323 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	DPF1	Q92782	380 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487		K7EIM0	57 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SNAPC5	O75971	98 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	DHODH	Q02127	395 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	GALNT14	Q96FL9	552 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A0G2JLM5	398 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	NXPH3	O95157	252 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	S100G	P29377	79 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CD40LG	P29965	261 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.27	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms