RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 NBR2O15453 112 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 Q0VFX4 171 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.127e-6■■■■□ 19.5
NISCH-213ENST00000489895 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 NAT1P18440 290 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 LY6DQ14210 128 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 A6NDN8 102 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 PRR32B1ATL7 298 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 UPK2O00526 184 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 GAS1P54826 345 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 FOXF2Q12947 444 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-46P01743 117 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 CCL3L1P16619 93 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 TCF24Q7RTU0 167 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SIGLEC5O15389 551 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 PKIAP61925 76 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 IFITM10A6NMD0 228 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 UBE2L6O14933 153 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 TRGC2P03986 189 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-48P01763 117 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FAM209BQ5JX69 171 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 JMJD8Q96S16 334 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 SDK2Q58EX2 2172 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 RRHO14718 337 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PSMB2P49721 201 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 C18orf12Q96KH6 178 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 SRRM5B3KS81 715 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZS92 163 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 TEX45Q8NA69 505 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 NUP37Q8NFH4 326 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 SFRP2Q96HF1 295 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MSGN1A6NI15 193 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 IGHG3P01860 377 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PLXNA3P51805 1871 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 IGFBP2P18065 325 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 VWA8A3KMH1 1905 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FHITP49789 147 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ICAM4Q14773 271 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PMCHL1Q16048 86 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 OR1P1Q8NH06 330 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 C15orf61A6NNL5 157 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ZNF383Q8NA42 475 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MPTX1A8MV57 137 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 C2orf83Q53S99 150 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 H3BTX0 84 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 TBX15Q96SF7 602 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ATG101Q9BSB4 218 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 M0R3E3 92 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 CENPWQ5EE01 88 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 CEP250Q9BV73 2442 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 GPR82Q96P67 336 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 GPR183P32249 361 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 BTCP35070 178 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 OR52E5Q8NH55 327 aa14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.1 ms