RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 SNAPC5O75971 98 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 NDUFB8O95169 186 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 IGHV3-23P01764 117 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 P0C879 139 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ECI1P42126 302 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 WT1-ASQ06250 92 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 TRIM16LQ309B1 348 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 DPF1Q92782 380 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-210ENST00000488157 A0A0B4J293 547 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 C15orf61A6NNL5 157 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 LINC01619G3V211 115 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 AKR1C4P17516 323 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 CCR6P51684 374 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 AP3S2P59780 193 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP10-11P60412 298 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SPINK9Q5DT21 86 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 Q6ZRM9 215 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 CADM3Q8N126 398 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 A0A0G2JLM5 398 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 CDS2O95674 445 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FGF2P09038 288 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 OR8U8P0C7N1 319 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 OR13C7P0DN81 318 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 IL7P13232 177 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 AKR1C2P52895 323 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 MFAP2P55001 183 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 ATP5G2Q06055 141 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 C15orf32Q32M92 178 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TRIQKQ629K1 86 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 OR4A16Q8NH70 328 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 USMG5Q96IX5 58 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 PRNDQ9UKY0 176 aa9.32□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FAM223BA6NKX1 122 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 ST8SIA3O43173 380 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 WIPF1O43516 503 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 BTCP35070 178 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMEM187Q14656 261 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 NECAP1Q8NC96 275 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 GPR146Q96CH1 333 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TSC22D3Q99576 134 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 NOTCH1P46531 2555 aa9.31□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 PPP5D1E7EU14 171 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 BMPR1BO00238 502 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 OVOL1O14753 267 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 PLA2G10O15496 165 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 DEFA4P12838 97 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 INPP1P49441 399 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 DHODHQ02127 395 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 KLK9Q2XQG4 91 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 OR5B3Q8NH48 314 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 GALNT14Q96FL9 552 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 CCDC140Q96MF4 163 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMEM56Q96MV1 263 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.3□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 B3GALNT1O75752 331 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 PRCDQ00LT1 54 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.29□□□□□ -0.92
NISCH-210ENST00000488157 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms