RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GUS0 222 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPM0 123 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ZNF716A6NP11 495 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 H7C1C5 153 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 LMX1BO60663 402 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CXorf1O96002 111 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1D-16P01601 117 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 LIPFP07098 398 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 FABP2P12104 132 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 NPPCP23582 126 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IER3P46695 156 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 CAMPP49913 170 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PSG4Q00888 419 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 IL11RAQ14626 422 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 BCORP1Q8N888 145 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 PIFOQ8TCI5 191 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 GLMPQ8WWB7 406 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RLN3Q8WXF3 142 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 OR4C12Q96R67 309 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 LIME1Q9H400 295 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 VSIRQ9H7M9 311 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 ERG28Q9UKR5 140 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RFNGQ9Y644 331 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 V9GYV3 84 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PKP4-211ENST00000481115 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 A0A0G2JLM5 398 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 M0R2Z0 102 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 BMPR1BO00238 502 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ANGPTL7O43827 346 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PDCD6O75340 191 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 DHRS3O75911 302 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 APCSP02743 223 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 IGHV4-34P06331 123 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 GP1BBP13224 206 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HTR1DP28221 377 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PTGER1P34995 402 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR1D4P47884 311 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FUT6P51993 359 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RPS21P63220 83 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.96□□□□□ -1.46
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PKP4-211ENST00000481115 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZVH6 145 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TCF23Q7RTU1 214 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PRSS33Q8NF86 280 aa5.96□□□□□ -1.46
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PKP4-211ENST00000481115 OR4A5Q8NH83 315 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OCC1Q8TAD7 63 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RNF114Q9Y508 228 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LRP4O75096 1905 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C17orf51A8MQB3 221 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 F5H697 171 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 H3BSH0 61 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TRIAP1O43715 76 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NDUFB4O95168 129 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SERPINE2P07093 398 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 IGFBP2P18065 325 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SRIP30626 198 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FXYD4P59646 89 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PMS2CLQ68D20 193 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 DOLPP1Q86YN1 238 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
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