RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ZNF45Q02386 682 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ZNF429Q86V71 674 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 DCUN1D4Q92564 292 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 TRIM63Q969Q1 353 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 TMEM56Q96MV1 263 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 GPR132Q9UNW8 380 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYF2-203ENST00000474160 AREGP15514 252 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 PI3P19957 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 UCP1P25874 307 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 ZNF79Q15937 498 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TATDN3Q17R31 274 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.58□□□□□ -0.08
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SYF2-203ENST00000474160 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.58□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 IGKV1-39P01597 117 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 IGKV1D-39P04432 117 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 SLURP1P55000 103 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 DHODHQ02127 395 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 C15orf32Q32M92 178 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 OR4A16Q8NH70 328 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 CXorf58Q96LI9 332 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TP53RKQ96S44 253 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.57□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.56□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 ACSM6Q6P461 480 aa14.56□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 FAM219AQ8IW50 185 aa14.56□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 NAA60Q9H7X0 242 aa14.56□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 MCUBQ9NWR8 336 aa14.56□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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SYF2-203ENST00000474160 AKR1C2P52895 323 aa14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 RPEL1Q2QD12 228 aa14.55□□□□□ -0.08
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SYF2-203ENST00000474160 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 GALNT14Q96FL9 552 aa14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 ATP6V0BQ99437 205 aa14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.55□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.54□□□□□ -0.08
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SYF2-203ENST00000474160 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 P0C879 139 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 OR13C7P0DN81 318 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 SRRQ9GZT4 340 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 NSG2Q9Y328 171 aa14.54□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 KRTAP10-11P60412 298 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 PRCDQ00LT1 54 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 WT1-ASQ06250 92 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 MRAPQ8TCY5 172 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 IL22RA2Q969J5 263 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 OR4C12Q96R67 309 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.53□□□□□ -0.08
SYF2-203ENST00000474160 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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SYF2-203ENST00000474160 SAP30O75446 220 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 IGKV1-5P01602 117 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 OR5AC1P0C628 307 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 ZNF114Q8NC26 417 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 HINT2Q9BX68 163 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 PEMTQ9UBM1 199 aa14.52□□□□□ -0.09
SYF2-203ENST00000474160 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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