RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF616	Q08AN1	781 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	BAK1	Q16611	211 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PTPA-222	ENST00000445241	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	HMX3	A6NHT5	357 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241		E7EUB6	86 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR5AC1	P0C628	307 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA3	P12429	323 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	AKR1C2	P52895	323 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01619	G3V211	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	IL7	P13232	177 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	AREG	P15514	252 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RHOG	P84095	191 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DPF1	Q92782	380 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	WIPF1	O43516	503 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	APELA	P0DMC3	54 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZP3	P21754	424 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	SP6	Q3SY56	376 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	AARD	Q4LEZ3	155 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	THYN1	Q9P016	225 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFB6	O95139	128 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DEFA4	P12838	97 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	AKR1C4	P17516	323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM187	Q14656	261 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0B4J2A0	478 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	MYOD1	P15172	320 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	INSL3	P51460	131 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	LGI3	Q8N145	548 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR5B12	Q96R08	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0B4J293	547 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PTPA-222	ENST00000445241	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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