RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	TERB2	Q8NHR7	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	CCDC140	Q96MF4	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	LY86	O95711	162 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	FGF2	P09038	288 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	EDN2	P20800	178 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	S100G	P29377	79 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	MFAP2	P55001	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	RPEL1	Q2QD12	228 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	SP6	Q3SY56	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	HINT2	Q9BX68	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	FABP12	A6NFH5	140 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	C15orf61	A6NNL5	157 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705		H0Y980	276 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	IGKV1-5	P01602	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	AKAIN1	P0CW23	69 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	OR13C7	P0DN81	318 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	DEFA4	P12838	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	CADM3	Q8N126	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705		V9GYH0	126 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	SNAPC5	O75971	98 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	SERPINE2	P07093	398 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	CSN3	P07498	182 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705		P0C879	139 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	MEF2D	Q14814	521 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A0G2JRQ6	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	OR2C1	O95371	312 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLV1-51	P01701	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF79	Q15937	498 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	COPZ2	Q9P299	210 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	PRND	Q9UKY0	176 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	DHFR	P00374	187 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	GP9	P14770	177 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	SPINK9	Q5DT21	86 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	B9D2	Q9BPU9	175 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	GPR132	Q9UNW8	380 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	OR5AC1	P0C628	307 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	UCP1	P25874	307 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	ARL3	P36405	182 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	OR4A16	Q8NH70	328 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A0B4J293	547 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	TRIM16L	Q309B1	348 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	PYDC2	Q56P42	97 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	OR5B3	Q8NH48	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM230	Q96A57	120 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CTBP2-204	ENST00000395705	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.74	□□□□□ -0.37

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