RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2J3O76001 311 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2B8PP59922 312 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPEL1Q2QD12 228 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM209BQ5JX69 171 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC160A6NGH7 325 aa14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CD74P04233 296 aa14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP5CP53041 499 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 C15orf32Q32M92 178 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF585BQ52M93 769 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNAPC5O75971 98 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRBV12-3P01733 135 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 REG1AP05451 166 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFA4P12838 97 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTRB1P17538 263 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 MEF2DQ14814 521 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCFD2Q8NI22 146 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CGB1A6NKQ9 187 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTDSPLO15194 276 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYNJ2BPP57105 145 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RND3P61587 244 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TATDN3Q17R31 274 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CADM3Q8N126 398 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSC22D3Q99576 134 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SERPINE2P07093 398 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI3P19957 117 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIGPP57054 158 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 LCN12Q6JVE5 192 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TERB2Q8NHR7 220 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRNDQ9UKY0 176 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 DISC1C4P0D8 188 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMPR1BO00238 502 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYB5BO43169 146 aa14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q8N402 240 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 HINT2Q9BX68 163 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 RETNQ9HD89 108 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 COPZ2Q9P299 210 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSG2Q9Y328 171 aa14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-204ENST00000373166 NDUFB8O95169 186 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKAIN1P0CW23 69 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLK9Q2XQG4 91 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 THYN1Q9P016 225 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 PEMTQ9UBM1 199 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 FABP12A6NFH5 140 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 C15orf61A6NNL5 157 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR13C7P0DN81 318 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNFSF8P32971 234 aa14.51□□□□□ -0.09
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