RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DEFA5Q01523 94 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF79Q15937 498 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 POU2AF1Q16633 256 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM63Q969Q1 353 aa5.9□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 BET1LQ9NYM9 111 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.9□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD11O94819 623 aa5.89□□□□□ -1.47
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SGMS1-201ENST00000361543 S1PR2O95136 353 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 KRASP01116 189 aa5.87□□□□□ -1.47
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM222Q9H0R3 208 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM140Q9NV12 185 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 GPR132Q9UNW8 380 aa5.87□□□□□ -1.47
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.87□□□□□ -1.47
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