RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 PELI1Q96FA3 418 aa4.15□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.15□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 MDFICQ9P1T7 246 aa4.15□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FABP2P12104 132 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LGALS4P56470 323 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 CTXN1P60606 82 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TGFBR3Q03167 851 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF74Q16587 644 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 Q6Q795 121 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM219Q86XT9 240 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 MDS2Q8NDY4 140 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RPRMQ9NS64 109 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TECTAO75443 2155 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf51A8MQB3 221 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C11orf98E9PRG8 122 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 HAX1O00165 279 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 NBL1P41271 181 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00477Q96M19 166 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 Q96M85 177 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RAXQ9Y2V3 346 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 CD1AP06126 327 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C3orf79P0CE67 100 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 IFITM1P13164 125 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R1AQ13522 171 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FAM27D1Q5T7N8 215 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LINC01587Q99440 93 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ATP5SQ99766 215 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C20orf78Q9BR46 151 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 VSIG4Q9Y279 399 aa4.14□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PQD3 144 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 NPFFO15130 113 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 GPR137BO60478 399 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 HSBP1O75506 76 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 OR2H2O95918 312 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 HLA-DQA2P01906 255 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FBXW4P57775 412 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 C4orf26Q17RF5 130 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 CR1LQ2VPA4 569 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RPTNQ6XPR3 784 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 VGLL1Q99990 258 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 PRNDQ9UKY0 176 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 R4GN57 208 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 U3KQA8 63 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 CHST1O43916 411 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ARL6IP5O75915 188 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RENP00797 406 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 CDK2P24941 298 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 FHL1Q13642 323 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 OTPQ5XKR4 325 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM86BQ8N661 226 aa4.13□□□□□ -1.75
CLVS1-201ENST00000325897 OR5D14Q8NGL3 314 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 241.7 ms