RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 C15orf61A6NNL5 157 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 B3GALNT1O75752 331 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 REG1AP05451 166 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 RHOGP84095 191 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 WT1-ASQ06250 92 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF343Q6P1L6 599 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR1L8Q8NGR8 309 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 USMG5Q96IX5 58 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TSC22D3Q99576 134 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 PRNDQ9UKY0 176 aa17.18■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 A0A0B4J293 547 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JRQ6 117 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SNAPC5O75971 98 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC2P0DI81 140 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC2BP0DI82 140 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 LINC00299Q6ZSB3 139 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 GALNT14Q96FL9 552 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SCGB3A2Q96PL1 93 aa17.17■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa17.16■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 LINC01619G3V211 115 aa17.16■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 IL7P13232 177 aa17.16■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 DEFA6Q01524 100 aa17.16■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TMEM187Q14656 261 aa17.16■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR2J3O76001 311 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB8O95169 186 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TRBV12-3P01733 135 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR8U8P0C7N1 319 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 SLURP1P55000 103 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 RAB25P57735 213 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TRIM16LQ309B1 348 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZRM9 215 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 NECAP1Q8NC96 275 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 OR5B3Q8NH48 314 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 DCUN1D4Q92564 292 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TMEM56Q96MV1 263 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 FKBP11Q9NYL4 201 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa17.15■□□□□ 0.34
SYF2-201ENST00000236273 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 FAM223BA6NKX1 122 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 BTCP35070 178 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 DHODHQ02127 395 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 TRIQKQ629K1 86 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 FAM223AQ8IWN6 122 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 DPF1Q92782 380 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PRR13Q9NZ81 148 aa17.14■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G10O15496 165 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 OR13C7P0DN81 318 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 AKR1C4P17516 323 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 CCR6P51684 374 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 MFAP2P55001 183 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 ATP5G2Q06055 141 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 ZNF429Q86V71 674 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 SGPP2Q8IWX5 399 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 OR4A16Q8NH70 328 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 BATF3Q9NR55 127 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 FBXL7Q9UJT9 491 aa17.13■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 WIPF1O43516 503 aa17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 C15orf32Q32M92 178 aa17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 HINT2Q9BX68 163 aa17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PTTG2Q9NZH5 202 aa17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 NAP1L6A6NFF2 107 aa17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 AKR1C2P52895 323 aa17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP10-11P60412 298 aa17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 GPR146Q96CH1 333 aa17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 ATG12O94817 140 aa17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PRCDQ00LT1 54 aa17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 AARDQ4LEZ3 155 aa17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 TMEM268Q5VZI3 342 aa17.1■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 ST8SIA3O43173 380 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 DHFRP00374 187 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 DEFA4P12838 97 aa17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SYF2-201ENST00000236273 INPP1P49441 399 aa17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms