RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 JTBO76095 146 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FGF2P09038 288 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GP9P14770 177 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RHOGP84095 191 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF45Q02386 682 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CADM3Q8N126 398 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCUN1D4Q92564 292 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CGB1A6NKQ9 187 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM223BA6NKX1 122 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNAPC5O75971 98 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SERPINE2P07093 398 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AREGP15514 252 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR2B8PP59922 312 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC190Q86UF4 302 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRRT1Q99946 306 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NSG2Q9Y328 171 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 V9GYH0 126 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 H0Y980 276 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OVOL1O14753 267 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DHFRP00374 187 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IGKV1-39P01597 117 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IGKV1D-39P04432 117 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRYGCP07315 174 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMB6P28072 239 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP5G2Q06055 141 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 Q8N402 240 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEC22AQ96IW7 307 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TP53RKQ96S44 253 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSC22D3Q99576 134 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR2J3O76001 311 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 REG1AP05451 166 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTRB1P17538 263 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF79Q15937 498 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NECAP1Q8NC96 275 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCUBQ9NWR8 336 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRNDQ9UKY0 176 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DEFA4P12838 97 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZP3P21754 424 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HINT2Q9BX68 163 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR132Q9UNW8 380 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AP3S2P59780 193 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM16LQ309B1 348 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C15orf32Q32M92 178 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SP6Q3SY56 376 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR4A16Q8NH70 328 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM63Q969Q1 353 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C15orf61A6NNL5 157 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 B3GALNT1O75752 331 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATG12O94817 140 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRBV12-3P01733 135 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ETV6P41212 452 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AKR1C2P52895 323 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms