RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 UPK2O00526 184 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 SAP30O75446 220 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 ZNF735P0CB33 412 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 DEFA5Q01523 94 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 MEF2DQ14814 521 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 FAM209BQ5JX69 171 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 ZNF429Q86V71 674 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 MCFD2Q8NI22 146 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.97□□□□□ -0.97
GGA3-204ENST00000578208 DISC1C4P0D8 188 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CYB5BO43169 146 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 SNAPC5O75971 98 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 KRASP01116 189 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PRH1P02810 166 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 FGF2P09038 288 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 DEFA4P12838 97 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 RPA2P15927 270 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ECI1P42126 302 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PPP5CP53041 499 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TATDN3Q17R31 274 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 NECAP1Q8NC96 275 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR4C12Q96R67 309 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TSC22D3Q99576 134 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 K7EIL1 84 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CTDSPLO15194 276 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR2J3O76001 311 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 LY86O95711 162 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CD74P04233 296 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 SERPINE2P07093 398 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PSMB6P28072 239 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 G6PCP35575 357 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR2B8PP59922 312 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ZNF45Q02386 682 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 RPEL1Q2QD12 228 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 COPZ2Q9P299 210 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PRNDQ9UKY0 176 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 FABP12A6NFH5 140 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 E7EUB6 86 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ATG12O94817 140 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 REG1AP05451 166 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CRYGCP07315 174 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 AKAIN1P0CW23 69 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 MYOD1P15172 320 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 AREGP15514 252 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 S100A5P33763 92 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PIGPP57054 158 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 RND3P61587 244 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 C15orf32Q32M92 178 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ZNF585BQ52M93 769 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ACSM6Q6P461 480 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CADM3Q8N126 398 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TERB2Q8NHR7 220 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 HINT2Q9BX68 163 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 H0Y980 276 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CTRB1P17538 263 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PI3P19957 117 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 TNFSF8P32971 234 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-204ENST00000578208 OR4A16Q8NH70 328 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms