RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540184.5

TULP3-205, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 5

Gene TULP3, Length 978 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-205	ENST00000540184	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	DEFA4	P12838	97 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	G6PC	P35575	357 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	INPP1	P49441	399 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	AP3S2	P59780	193 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184		Q8N402	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	RND3	P61587	244 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TULP3-205	ENST00000540184	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	CYB5B	O43169	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	BRI3	O95415	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	PRH1	P02810	166 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	RHOG	P84095	191 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184		A0A087WW49	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184		H0Y980	276 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OVOL1	O14753	267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	MYOD1	P15172	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	ZP3	P21754	424 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	PSMB6	P28072	239 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	AKR1C2	P52895	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OR2B8P	P59922	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	FHL3	Q13643	280 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	OR2J3	O76001	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	REG1A	P05451	166 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	FGF2	P09038	288 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	AREG	P15514	252 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	SLURP1	P55000	103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	DEFA5	Q01523	94 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TULP3-205	ENST00000540184	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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