RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532885.5

RPS6KA4-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 3

Gene RPS6KA4, Length 902 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	UPK2	O00526	184 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CTDSPL	O15194	276 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RAB3D	O95716	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PRH1	P02810	166 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PGAM2	P15259	253 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF429	Q86V71	674 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NECAP1	Q8NC96	275 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MCFD2	Q8NI22	146 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SAP30	O75446	220 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	KRAS	P01116	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CD74	P04233	296 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RPA2	P15927	270 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF45	Q02386	682 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MEF2D	Q14814	521 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM209B	Q5JX69	171 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RPS6KA4-208	ENST00000532885		E7EUB6	86 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885		K7EIL1	84 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SNAPC5	O75971	98 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DEFA4	P12838	97 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PSMB6	P28072	239 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	G6PC	P35575	357 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ECI1	P42126	302 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR2B8P	P59922	312 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CADM3	Q8N126	398 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885		A0A1B0GW64	132 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR2J3	O76001	311 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SERPINE2	P07093	398 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CRYGC	P07315	174 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MYOD1	P15172	320 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AREG	P15514	252 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PPP5C	P53041	499 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RND3	P61587	244 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TATDN3	Q17R31	274 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RPEL1	Q2QD12	228 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C15orf32	Q32M92	178 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ACSM6	Q6P461	480 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TERB2	Q8NHR7	220 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FABP12	A6NFH5	140 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CYB5B	O43169	146 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	AKAIN1	P0CW23	69 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CTRB1	P17538	263 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TNFSF8	P32971	234 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PIGP	P57054	158 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	COPZ2	Q9P299	210 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PRND	Q9UKY0	176 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CGB1	A6NKQ9	187 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885		H0Y980	276 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRBV12-3	P01733	135 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	REG1A	P05451	166 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PI3	P19957	117 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	S100A5	P33763	92 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RPS6KA4-208	ENST00000532885	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		12.74	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms