RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 GON7Q9BXV9 100 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 MFFQ9GZY8 342 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 ESM1Q9NQ30 184 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 DPM3Q9P2X0 92 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 MBD2Q9UBB5 411 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 HMSDA8MTL9 139 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 TSC22D2O75157 780 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 PROP1O75360 226 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV1-39P01597 117 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV1-69P01742 117 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV1D-39P04432 117 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC25A6P12236 298 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 ARL3P36405 182 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM65Q6PI78 240 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 SSX9Q7RTT3 188 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CFHR4Q92496 578 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CLCC1Q96S66 551 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A0U1RQK1 487 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 MARCH11A6NNE9 402 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 E5RGE8 158 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 H0YJW9 148 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 SSSCA1O60232 199 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 GPR137BO60478 399 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 MED6O75586 246 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 NXPH3O95157 252 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV1-47P01700 117 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CLEC3BP05452 202 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 ARHGDIBP52566 201 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF137PP52743 207 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IFITM2Q01629 132 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 PDPNQ86YL7 162 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 DDB2Q92466 427 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 NABP2Q9BQ15 211 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 NSG2Q9Y328 171 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.47□□□□□ -1.21
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A0D9SG52 128 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A0G2JRQ6 117 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 K7EPK0 472 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 NPFFO15130 113 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 DEDDO75618 318 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2F2O95006 317 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 IFNA17P01571 189 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 UBE2E1P51965 193 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 IL15RAQ13261 267 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2F1Q13607 317 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 TMUB2Q71RG4 321 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 RAB24Q969Q5 203 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 HARBI1Q96MB7 349 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 RNF126Q9BV68 326 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 ARL6Q9H0F7 186 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM140Q9NV12 185 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 COA4Q9NYJ1 87 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN18-208ENST00000520837 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms