RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	SFTPC	P11686	197 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	PRRX1	P54821	245 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	FOXL1	Q12952	345 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	APELA	P0DMC3	54 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	TDGF1P3	P51864	188 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	CKS2	P33552	79 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PRS3	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	PSMB2	P49721	201 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574		A1L4Q6	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	COX7A1	P24310	79 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	TBR1	Q16650	682 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKD1-222	ENST00000496574	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TSC2	P49815	1807 aa		11.96	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	CD33	P20138	364 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	RLF	Q13129	1914 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	SNAI2	O43623	268 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	PLAUR	Q03405	335 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	HGFAC	Q04756	655 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	IGFBP2	P18065	325 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF146	Q15072	292 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	EFEMP2	O95967	443 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TIMP3	P35625	211 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	PTPRD	P23468	1912 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1B0GV72	72 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	HERVK_113	P61574	105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574		H3BVH4	76 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TIAF1	O95411	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	UMOD	P07911	640 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	CD40	P25942	277 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	WDR31	Q8NA23	367 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TWIST1	Q15672	202 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	VWCE	Q96DN2	955 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-222	ENST00000496574	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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