RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490332.2

PTPRK-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-213	ENST00000490332	PMP22	Q01453	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ICAM4	Q14773	271 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	HAGH	Q16775	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RND1	Q92730	232 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	LHX4	Q969G2	390 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	COQ2	Q96H96	371 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RARRES2	Q99969	163 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CAD	P27708	2225 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	VWF	P04275	2813 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CLDN34	H7C241	214 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	AP4M1	O00189	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	UBE2C	O00762	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	WNT9B	O14905	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF737	O75373	536 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	LHB	P01229	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OPN1MW	P04001	364 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IRF2	P14316	349 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	NQO2	P16083	231 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	THBS3	P49746	956 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MEOX2	P50222	304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR2B8P	P59922	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DLK1	P80370	383 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	FOXF2	Q12947	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RAB31	Q13636	194 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SSX2	Q16385	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MORN2	Q502X0	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332		Q6ZR03	302 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CORO2A	Q92828	525 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RAB1C	Q92928	201 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	S1PR3	Q99500	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SSX3	Q99909	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332		A0A1B0GV50	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332		A0A1W2PPH5	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms