RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MARCH11A6NNE9 402 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TEX22C9J3V5 150 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UPK2O00526 184 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SAP30O75446 220 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRH1P02810 166 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF735P0CB33 412 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPA2P15927 270 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ECI1P42126 302 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DEFA5Q01523 94 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF429Q86V71 674 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM229BQ8NBD8 167 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NECAP1Q8NC96 275 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RAB3DO95716 219 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRASP01116 189 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DEFA4P12838 97 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TBC1D26Q86UD7 250 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MCFD2Q8NI22 146 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 K7EIL1 84 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SNAPC5O75971 98 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FGF2P09038 288 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MEF2DQ14814 521 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STEAP1BQ6NZ63 245 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR4C12Q96R67 309 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR2J3O76001 311 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SERPINE2P07093 398 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AREGP15514 252 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PSMB6P28072 239 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 G6PCP35575 357 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR2B8PP59922 312 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TATDN3Q17R31 274 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C15orf32Q32M92 178 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM209BQ5JX69 171 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 E7EUB6 86 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTDSPLO15194 276 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CYB5BO43169 146 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LY86O95711 162 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CD74P04233 296 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYOD1P15172 320 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PPP5CP53041 499 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF45Q02386 682 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPEL1Q2QD12 228 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TERB2Q8NHR7 220 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TSC22D3Q99576 134 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FBXL7Q9UJT9 491 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FABP12A6NFH5 140 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DISC1C4P0D8 188 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 REG1AP05451 166 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRYGCP07315 174 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PIGPP57054 158 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF585BQ52M93 769 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ACSM6Q6P461 480 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HINT2Q9BX68 163 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FKBP11Q9NYL4 201 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COPZ2Q9P299 210 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRNDQ9UKY0 176 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A1B0GW64 132 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AKAIN1P0CW23 69 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTRB1P17538 263 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PI3P19957 117 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RND3P61587 244 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CADM3Q8N126 398 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR51B2Q9Y5P1 312 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV12-3P01733 135 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNFSF8P32971 234 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXB-AS3-212ENST00000487849 S100A5P33763 92 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms