RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 SHOXO15266 292 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 CRYZL1O95825 349 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 HLA-DRB1P01911 266 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 OR8U8P0C7N1 319 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 LPAR6P43657 344 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 TAS2R31P59538 309 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 NPBQ8NG41 125 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 OR11H1Q8NG94 326 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 OR4S2Q8NH73 311 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 RITA1Q96K30 269 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.97□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 TENM2Q9NT68 2774 aa8.96□□□□□ -0.97
GARNL3-217ENST00000481875 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 LCE2BO14633 110 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV1-16P04430 117 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SERPINE2P07093 398 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 LGALS7P47929 136 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SP6Q3SY56 376 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM177Q53S58 311 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 PLET1Q6UQ28 207 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF429Q86V71 674 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RNF5Q99942 180 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 NAA60Q9H7X0 242 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 NUDT15Q9NV35 164 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 KIAA1456Q9P272 454 aa8.96□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 H0Y980 276 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 B3GALNT1O75752 331 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 HPRT1P00492 218 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 HRASP01112 189 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 OR5AC1P0C628 307 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ANXA3P12429 323 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RAB9AP51151 201 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RAB25P57735 213 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 DHODHQ02127 395 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF616Q08AN1 781 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 MMDQ15546 238 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TRIM16LQ309B1 348 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 C4orf46Q504U0 113 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM230Q96A57 120 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 HARBI1Q96MB7 349 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 PRR25Q96S07 402 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TP53RKQ96S44 253 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 KLK15Q9H2R5 256 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 OR51J1Q9H342 316 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.95□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 NBR2O15453 112 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFA3O95167 84 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 PTTG1O95997 202 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RPA2P15927 270 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 CNTFRP26992 372 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ERVK-16P61578 105 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 PLGLAQ15195 96 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RGS21Q2M5E4 152 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF585BQ52M93 769 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM65Q6PI78 240 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SSX9Q7RTT3 188 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 TNCP24821 2201 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 LYSTQ99698 3801 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 C9orf170A2RU37 121 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 RRHO14718 337 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A17O43808 307 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 ATG12O94817 140 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 S1PR2O95136 353 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SFT2D2O95562 160 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 KRASP01116 189 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 OR4E1P0C645 316 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 NQO2P16083 231 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 SPNP16150 400 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 UCP1P25874 307 aa8.93□□□□□ -0.98
GARNL3-217ENST00000481875 PPP1R1AQ13522 171 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms