RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JLM5 398 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 PRH1P02810 166 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 PGAM2P15259 253 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 PI3P19957 117 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP10-11P60412 298 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 RND3P61587 244 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 MEF2DQ14814 521 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 CADM3Q8N126 398 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.16■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 NPIPB5A8MRT5 1133 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 KRASP01116 189 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 FGF2P09038 288 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 33.5
ACTB-211ENST00000480301 PPP5CP53041 499 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 SLURP1P55000 103 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 OR2B8PP59922 312 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-16P61578 105 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A42Q86VD7 318 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 DCUN1D4Q92564 292 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 USMG5Q96IX5 58 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 V9GYH0 126 aa16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-39P01597 117 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-39P04432 117 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 CRYGCP07315 174 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 AKAIN1P0CW23 69 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 AREGP15514 252 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 G6PCP35575 357 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 PIGPP57054 158 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 C19orf35Q6ZS72 473 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.14■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 DISC1C4P0D8 188 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 RHOGP84095 191 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 REC114Q7Z4M0 266 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 CCDC190Q86UF4 302 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SEC22AQ96IW7 307 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.13■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 DPPA5A6NC42 116 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SEC14L6B5MCN3 397 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 CTRB1P17538 263 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 PSMB6P28072 239 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 S100A5P33763 92 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 NSG2Q9Y328 171 aa16.12■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 IGLC7A0M8Q6 106 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 FAM223BA6NKX1 122 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 OVOL1O14753 267 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 KLK9Q2XQG4 91 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 NECAP1Q8NC96 275 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 FANCD2OSQ96PS1 177 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 TP53RKQ96S44 253 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 COPZ2Q9P299 210 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.11■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 H0Y980 276 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 OR2J3O76001 311 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 TRBV12-3P01733 135 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 REG1AP05451 166 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ECI1P42126 302 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ATP5G2Q06055 141 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 ZNF79Q15937 498 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 PYDC2Q56P42 97 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 GPR132Q9UNW8 380 aa16.1■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SNAPC5O75971 98 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SERPINE2P07093 398 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 OR10W1Q8NGF6 305 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms