RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TEX22C9J3V5 150 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 UPK2O00526 184 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DHFRP00374 187 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 FGF2P09038 288 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF735P0CB33 412 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZP3P21754 424 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 INSL3P51460 131 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SLURP1P55000 103 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RHOGP84095 191 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 MEF2DQ14814 521 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DCUN1D4Q92564 292 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 FABP12A6NFH5 140 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 KRASP01116 189 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFSF8P32971 234 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CADM3Q8N126 398 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TERB2Q8NHR7 220 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DISC1C4P0D8 188 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SNAPC5O75971 98 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PRH1P02810 166 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 AKAIN1P0CW23 69 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RPA2P15927 270 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 S100A5P33763 92 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ECI1P42126 302 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP5CP53041 499 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP10-11P60412 298 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RND3P61587 244 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFA5Q01523 94 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP5G2Q06055 141 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF585BQ52M93 769 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM209BQ5JX69 171 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 NECAP1Q8NC96 275 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TSC22D3Q99576 134 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 E7EUB6 86 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINE2P07093 398 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFA4P12838 97 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 MYOD1P15172 320 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMB6P28072 239 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 G6PCP35575 357 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGPP57054 158 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2B8PP59922 312 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF45Q02386 682 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF429Q86V71 674 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 COPZ2Q9P299 210 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1B0GW64 132 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SAP30O75446 220 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2J3O76001 311 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CRYGCP07315 174 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 AREGP15514 252 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CTRB1P17538 263 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PI3P19957 117 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 C15orf32Q32M92 178 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PRRT1Q99946 306 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 PRNDQ9UKY0 176 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CGB1A6NKQ9 187 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 H0Y980 276 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB5BO43169 146 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ATG12O94817 140 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 REG1AP05451 166 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 TATDN3Q17R31 274 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RPEL1Q2QD12 228 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms