RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C19orf35Q6ZS72 473 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMBX1Q8NFW5 382 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPF1Q92782 380 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRGPRFQ96AM1 343 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FABP12A6NFH5 140 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MARCH11A6NNE9 402 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01619G3V211 115 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TERB2Q8NHR7 220 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCUN1D4Q92564 292 aa19.26■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0G2JLM5 398 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRASP01116 189 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PGAM2P15259 253 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AREGP15514 252 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP5CP53041 499 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2B8PP59922 312 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR61Q9BZJ8 451 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV1-39P01597 117 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGKV1D-39P04432 117 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 S100GP29377 79 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 G6PCP35575 357 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RND3P61587 244 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USMG5Q96IX5 58 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKIP1Q9NQ31 210 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPIPB5A8MRT5 1133 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RHOGP84095 191 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MEF2DQ14814 521 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REC114Q7Z4M0 266 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR4C16Q8NGL9 310 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 V9GYH0 126 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD34BA5PLL1 514 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC14L6B5MCN3 397 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRBV12-3P01733 135 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRYGCP07315 174 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGF2P09038 288 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKAIN1P0CW23 69 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIGPP57054 158 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVK-16P61578 105 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF343Q6P1L6 599 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A42Q86VD7 318 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CADM3Q8N126 398 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR13C8Q8NGS7 320 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MARCH1Q8TCQ1 289 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMB6P28072 239 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FANCD2OSQ96PS1 177 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NSG2Q9Y328 171 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TGP01266 2768 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLC7A0M8Q6 106 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM223BA6NKX1 122 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OVOL1O14753 267 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REG1AP05451 166 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTRB1P17538 263 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf66Q5T8R8 295 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTRB2Q6GPI1 263 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC190Q86UF4 302 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM223AQ8IWN6 122 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC22AQ96IW7 307 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TP53RKQ96S44 253 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COMMD5Q9GZQ3 224 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPPA5A6NC42 116 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DISC1C4P0D8 188 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2J3O76001 311 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF79Q15937 498 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLK9Q2XQG4 91 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NECAP1Q8NC96 275 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR10W1Q8NGF6 305 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZFAND1Q8TCF1 268 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLK9Q9UKQ9 250 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DBX1A6NMT0 343 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0Y980 276 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP5G2Q06055 141 aa19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 K7EIL1 84 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 S100A5P33763 92 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C15orf32Q32M92 178 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PYDC2Q56P42 97 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR51S1Q8NGJ8 323 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM63Q969Q1 353 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C5orf66Q9H5L9 145 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COPZ2Q9P299 210 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMRT1Q9Y5R6 373 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms