RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368567.4

RPS27-201, Transcript of ribosomal protein S27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS27, Length 350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27-201ENST00000368567 MAGEA12P43365 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 PPICP45877 212 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 KCNJ3P48549 501 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 HCCSP53701 268 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CTBP2P56545 445 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 LINC00313P59037 77 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TPI1P60174 286 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RAB10P61026 200 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 PAFAH1B2P68402 229 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CCL7P80098 99 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 LCN2P80188 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 GLO1Q04760 184 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RAD51Q06609 339 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 C2orf80Q0P641 193 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ADIGQ0VDE8 80 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 XRCC4Q13426 336 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 GUSBP1Q15486 140 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR1Q1Q15612 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RAB11BQ15907 218 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 SSX2Q16385 188 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 PSG3Q16557 428 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TMEM241Q24JQ0 296 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 FAM229BQ4G0N7 80 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ACTBL2Q562R1 376 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ACTL10Q5JWF8 245 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TIMM23BQ5SRD1 257 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RESP18Q5W5W9 173 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CARD17Q5XLA6 110 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 NIPAL1Q6NVV3 410 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 C8orf74Q6P047 294 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 SPESP1Q6UW49 350 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 LRRN1Q6UXK5 716 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CLEC19AQ6UXS0 136 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ALKAL1Q6UXT8 129 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 IZUMO2Q6UXV1 221 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 COPS6Q7L5N1 327 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TAS2R42Q7RTR8 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 SCXQ7RTU7 201 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 SLC16A14Q7RTX9 510 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 LINC00596Q86U02 117 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CTAGE6Q86UF2 777 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 HORMAD1Q86X24 394 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ANGPTL5Q86XS5 388 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 C1orf174Q8IYL3 243 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ZFP82Q8N141 532 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 FAM58AQ8N1B3 248 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 Q8N2B8 174 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 SYS1Q8N2H4 156 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 UBE2J2Q8N2K1 259 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TRAM1L1Q8N609 369 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TMEM156Q8N614 296 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 YIPF7Q8N8F6 280 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 DAND5Q8N907 189 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR2M3Q8NG83 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR4K2Q8NGD2 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR51L1Q8NGJ5 315 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR52K1Q8NGK4 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR5H2Q8NGV7 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 MFSD8Q8NHS3 518 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ERMNQ8TAM6 284 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TCP10LQ8TDR4 215 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 GPX8Q8TED1 209 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 DDI1Q8WTU0 396 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CT55Q8WUE5 264 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TMEM234Q8WY98 164 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 SLC38A4Q969I6 547 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TMBIM1Q969X1 311 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 UBE2WQ96B02 151 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RCN3Q96D15 328 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TPD52L3Q96J77 140 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ARL5BQ96KC2 179 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR4C12Q96R67 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CHP1Q99653 195 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 DHRS9Q9BPW9 319 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 UPK3BQ9BT76 320 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 C20orf24Q9BUV8 137 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ZYG11BQ9C0D3 744 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 BPESC1Q9GZL8 116 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 ARV1Q9H2C2 271 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 FBXL15Q9H469 300 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 WDR54Q9H977 334 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 VPS37BQ9H9H4 285 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 RAB20Q9NX57 234 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 TAS2R9Q9NYW1 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 OR5V1Q9UGF6 321 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 PITPNC1Q9UKF7 332 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 CCL26Q9Y258 94 aa0.06□□□□□ -2.4
RPS27-201ENST00000368567 PKIGQ9Y2B9 76 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms