RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 E5RGE8 158 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 GPR137BO60478 399 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 DEDDO75618 318 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CNIH1O95406 144 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 LY86O95711 162 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CHRNA7P36544 502 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ID3Q02535 119 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 LY6EQ16553 131 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF546Q86UE3 836 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 NOXA1Q86UR1 476 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N6K4 173 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR5B3Q8NH48 314 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR52E5Q8NH55 327 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RAB40CQ96S21 281 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RBKSQ9H477 322 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 MBD2Q9UBB5 411 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 M0QZK8 103 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CHST1O43916 411 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR2F2O95006 317 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CA2P00918 260 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OPN1MWP04001 364 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 IAPPP10997 89 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A4P12235 298 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SRD5A1P18405 259 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 IL15RAQ13261 267 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS8Q16651 343 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 Q6YL49 198 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM219Q86XT9 240 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 DTD1Q8TEA8 209 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SMR3AQ99954 134 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PSENENQ9NZ42 101 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ARPC5O15511 151 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 FGF16O43320 207 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CRYGBP07316 175 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 IER3P46695 156 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 CAV2P51636 162 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 Q5BKY6 102 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SPINK9Q5DT21 86 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N9W7 124 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-201ENST00000368202 A6NDX4 124 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV4-59P01825 116 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 C4BPBP20851 252 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 P2RY1P47900 373 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R30P59541 319 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 PRCDQ00LT1 54 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 FXYD3Q14802 87 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 AARDQ4LEZ3 155 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 PIFOQ8TCI5 191 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 HMSDA8MTL9 139 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 IFNA10P01566 189 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-DRB1P01911 266 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 LYL1P12980 280 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 MYOD1P15172 320 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 SNCAP37840 140 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-201ENST00000368202 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms