RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 J3KRW8 73 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 PPOXP50336 477 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 IGHV3-48P01763 117 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 CA7P43166 264 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 ARF6P62330 175 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 PINLYPA6NC86 204 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 FAM106CPP0CH98 169 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 CD40P25942 277 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 TFF3Q07654 80 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 FHL1Q13642 323 aa14.84□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.83□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.83□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.83□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM189A5PLL7 270 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TM4SF5O14894 197 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 REG1AP05451 166 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 A0A087WWC5 75 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 MFAP4P55083 255 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 Q1RN00 199 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 OR4A47Q6IF82 309 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 GGNQ86UU5 652 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.83□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 DDTP30046 118 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 LCN2P80188 198 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM177Q53S58 311 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 B9A039 149 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 CENPWQ5EE01 88 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 IFITM10A6NMD0 228 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 E9PQ18 207 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.82□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SRIP30626 198 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 THADAQ6YHU6 1953 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 AMY1AP04745 511 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 FAM209BQ5JX69 171 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 MUC15Q8N387 334 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 LIPFP07098 398 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMPRSS3P57727 454 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 PMCHL1Q16048 86 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 RABAC1Q9UI14 185 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 PLAURQ03405 335 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 MYLKQ15746 1914 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 DOCK7Q96N67 2140 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 RELBQ01201 579 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 SGK494Q96LW2 274 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 IGFBP2P18065 325 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.8□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 GUCD1Q96NT3 240 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 PNKDQ8N490 385 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 H3BTX0 84 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 LEPROTL1O95214 131 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 CBLN1P23435 193 aa14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SCARB2-201ENST00000264896 WDR82Q6UXN9 313 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms