RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 STX12Q86Y82 276 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8H3Q8N146 312 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PPI3 338 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OOSP1A8MZH6 123 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV2-23P01705 113 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRD1Q13241 179 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 MINOS1Q5TGZ0 78 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TBX15Q96SF7 602 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF5Q99942 180 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM3Q9BZL3 60 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CEBPZOSA8MTT3 80 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD11O94819 623 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TOX4O94842 621 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNA17P01571 189 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP10-9P60411 292 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB14P61106 215 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS16P62249 146 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX8Q06710 450 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 VSTM2AQ8TAG5 236 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf159Q96HA4 380 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A32Q9H2D1 315 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TCF19Q9Y242 345 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CST7O76096 145 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNLT3P51808 116 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 MOB3BQ86TA1 216 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ZDHHC16Q969W1 377 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 GINS3Q9BRX5 216 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00862A6NCI5 91 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BP45 60 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CD1BP29016 333 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2E1P51965 193 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF266Q14584 549 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HAPLN4Q86UW8 402 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX45Q8NA69 505 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5C1Q8NGR4 320 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4C12Q96R67 309 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP50Q9UKX7 468 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DFFBO76075 338 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 VMA21Q3ZAQ7 101 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5B3Q8NH48 314 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CLCC1Q96S66 551 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5SQ99766 215 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PMS2P5A8MQ11 134 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYGBP07316 175 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 NMBP08949 121 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RPP30P78346 268 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL16Q0P5N6 197 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC20Q8TCA0 184 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CFHR4Q92496 578 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A096LNT2 108 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL15P1P0C7V9 234 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HBG1P69891 147 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HBG2P69892 147 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PRCDQ00LT1 54 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB113Q30KQ7 82 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD6Q96DN6 1003 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 RITA1Q96K30 269 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HIPK2Q9H2X6 1198 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf62A8K5M9 175 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 INS-IGF2F8WCM5 200 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM23O14925 209 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FGF16O43320 207 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V1G1O75348 118 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC11BP0C7V7 166 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL8P62917 257 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CLINT1Q14677 625 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V1FQ16864 119 aa18.32■□□□□ 0.52
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