RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 C4BPBP20851 252 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 ORAI1Q96D31 301 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 OR2D2Q9H210 308 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 RDH8Q9NYR8 311 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-212ENST00000582376 FAT1Q14517 4588 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 OR2T8A6NH00 312 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 C15orf62A8K5M9 175 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 E7EUB6 86 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CHEK1O14757 476 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 REG1AP05451 166 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ZNF735P0CB33 412 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 HTN3P15516 51 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 PSMD7P51665 324 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 PLA2G7Q13093 441 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 C5orf30Q96GV9 206 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 OR51E2Q9H255 320 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 THYN1Q9P016 225 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CKLFQ9UBR5 152 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 MAS1LP35410 378 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 EMP1P54849 157 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TCF24Q7RTU0 167 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TMEM189A5PLL7 270 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 AQP12BA6NM10 295 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 LINC00473A8K010 186 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 FKBP6O75344 327 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 KBTBD11O94819 623 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CD5P06127 495 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DLK1P80370 383 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ARFRP1Q13795 201 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ICAM4Q14773 271 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ATP6AP1Q15904 470 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CDH26Q8IXH8 852 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 LGALS12Q96DT0 336 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 Q9N2K0 584 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 GHRLQ9UBU3 117 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 KNCNA6PVL3 124 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 FCGR3BO75015 233 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DCTN3O75935 186 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 SERPINB10P48595 397 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.48□□□□□ -1.37
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