RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CRYGC	P07315	174 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618		J3QRK9	145 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	HRAS	P01112	189 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	PSMB6	P28072	239 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	AQP4	P55087	323 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	SCGN	O76038	276 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	NDUFB8	O95169	186 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	EDN2	P20800	178 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	GAL	P22466	123 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPATA20-223	ENST00000513618	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	DEFA4	P12838	97 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	CTRB1	P17538	263 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	MLX	Q9UH92	298 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A1B0GW64	132 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618		E7EUB6	86 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	AREG	P15514	252 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	HLA-G	P17693	338 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	GNG2	P59768	71 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	MSMO1	Q15800	293 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	THYN1	Q9P016	225 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618		S4R3C0	116 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	NUPR2	A6NF83	97 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	CLEC3B	P05452	202 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SPATA20-223	ENST00000513618	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.17	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms