RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MRAP2Q96G30 205 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SPACA5Q96QH8 159 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5B12Q96R08 314 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TM2D1Q9BX74 207 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ACACBO00763 2458 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ESPL1Q14674 2120 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DPRXA6NFQ7 191 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GNB2P62879 340 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF154Q13106 437 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 UNC119Q13432 240 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MKXQ8IYA7 352 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RFNGQ9Y644 331 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ITPR1Q14643 2758 aa6.06□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LRP5LA4QPB2 252 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF732B4DXR9 585 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QT63 122 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TAX1BP3O14907 124 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF205O95201 554 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HBE1P02100 147 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CD99P14209 185 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CA6P23280 308 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL3P36405 182 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 UQCRFS1P47985 274 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 EFNB2P52799 333 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HERV-K104P63124 156 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 BSPH1Q075Z2 132 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ADIPOQQ15848 244 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF144BQ7Z419 303 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CALHM1Q8IU99 346 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNK15Q9H427 330 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GW15 77 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNL4K9M1U5 179 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LILRA1O75019 489 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SFT2D2O95562 160 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CD3EP07766 207 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLC1P0CG04 106 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PPOXP50336 477 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FABP6P51161 128 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GPM6AP51674 278 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IGFBP7Q16270 282 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC15Q8N387 334 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF843Q8N446 348 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF611Q8N823 705 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51I2Q9H344 312 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 USP24Q9UPU5 2620 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MPIG6BO95866 241 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HRASP01112 189 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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