RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 OR4A16Q8NH70 328 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 LYZL6O75951 148 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 OPRK1P41145 380 aa7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 TAS2R60P59551 318 aa7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 LINC00473A8K010 186 aa7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.24□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 Q6ZT83 130 aa7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 OR52E5Q8NH55 327 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 GNG12Q9UBI6 72 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 LAMA5O15230 3695 aa7.22□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.22□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 SDSLQ96GA7 329 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 SFRP2Q96HF1 295 aa7.22□□□□□ -1.25
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PKP4-210ENST00000480171 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 EDDM3AQ14507 147 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 Q6ZR03 302 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 Q8N7P7 452 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 DPF1Q92782 380 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TRIB1Q96RU8 372 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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