RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 MSGN1A6NI15 193 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 H3BMQ9 156 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 CTDSPLO15194 276 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 TNFSF12O43508 249 aa10.37□□□□□ -0.75
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PRAME-211ENST00000476336 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.37□□□□□ -0.75
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PRAME-211ENST00000476336 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
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PRAME-211ENST00000476336 TERB2Q8NHR7 220 aa10.34□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 MCFD2Q8NI22 146 aa10.34□□□□□ -0.75
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PRAME-211ENST00000476336 TSC22D3Q99576 134 aa10.34□□□□□ -0.75
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PRAME-211ENST00000476336 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 RAB3DO95716 219 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 CD3DP04234 171 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 ZNF735P0CB33 412 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 RPA2P15927 270 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 S100A5P33763 92 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 STEAP1BQ6NZ63 245 aa10.33□□□□□ -0.76
PRAME-211ENST00000476336 SSX9Q7RTT3 188 aa10.33□□□□□ -0.76
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