RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MOSP00540 346 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 RRASP10301 218 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf87Q6NUJ2 197 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 ESM1Q9NQ30 184 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 POMT1Q9Y6A1 747 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 RAMP3O60896 148 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 PET100P0DJ07 73 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM11P17152 192 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM65Q6PI78 240 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM219Q86XT9 240 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 RITA1Q96K30 269 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP57Q9NU63 452 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 GSKIPQ9P0R6 139 aa23.65■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 CRYZL1O95825 349 aa23.64■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 FAM219AQ8IW50 185 aa23.64■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf62Q8N4C0 152 aa23.64■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHA2Q9HB19 425 aa23.64■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 VPREB3Q9UKI3 123 aa23.64■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 A6NDX4 124 aa23.63■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 HILS1P60008 231 aa23.63■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM86BQ8N661 226 aa23.63■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 OR4S2Q8NH73 311 aa23.63■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 THAP6Q8TBB0 222 aa23.63■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 PITPNC1Q9UKF7 332 aa23.63■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GU03 582 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 HPRT1P00492 218 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 LYL1P12980 280 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 Q8N6K4 173 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 OR4D5Q8NGN0 318 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 OR4C13Q8NGP0 309 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-5P01602 117 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa23.62■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 AKR1C2P52895 323 aa23.61■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RPS16P62249 146 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RAB32Q13637 225 aa23.61■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM177Q53S58 311 aa23.61■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 GRPEL2Q8TAA5 225 aa23.61■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 MMP24Q9Y5R2 645 aa23.61■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 S1PR2O95136 353 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS54Q6PEW0 395 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 GPR146Q96CH1 333 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 HARBI1Q96MB7 349 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 JMJD8Q96S16 334 aa23.6■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 SHOXO15266 292 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 TCF21O43680 179 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 P0C879 139 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 CNTFRP26992 372 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 F2RL1P55085 397 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A33Q9BSK2 321 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RNF126Q9BV68 326 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 COA4Q9NYJ1 87 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 PITX3O75364 302 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF546Q86UE3 836 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 RNF5Q99942 180 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 MBD2Q9UBB5 411 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 HSPB11Q9Y547 144 aa23.59■■□□□ 1.37
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JRQ6 117 aa23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN34H7C241 214 aa23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 CHST1O43916 411 aa23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 OR2F2O95006 317 aa23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 SMCO1Q147U7 214 aa23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 MMDQ15546 238 aa23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 MBPP02686 304 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 RLN2P04090 185 aa23.57■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 PLSCR3Q9NRY6 295 aa23.57■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF18Q9UNG2 199 aa23.57■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 H0YIZ8 118 aa23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 ST8SIA3O43173 380 aa23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 DEDDO75618 318 aa23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 LGALS7P47929 136 aa23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 ARPC5O15511 151 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 KRASP01116 189 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 C4BPBP20851 252 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 S100A10P60903 97 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 R3HDM4Q96D70 268 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 MARCH11A6NNE9 402 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 K7EPK0 472 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 NBR2O15453 112 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 GPR137BO60478 399 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV2-23P01705 113 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 NQO2P16083 231 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 G6PCP35575 357 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 UBA52P62987 128 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 ID3Q02535 119 aa23.55■■□□□ 1.36
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF345Q14585 488 aa23.55■■□□□ 1.36
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