RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GUS0 222 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 IGSF23A1L1A6 192 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 OR2T8A6NH00 312 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 SHISA7A6NL88 538 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 K7EP34 96 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 PLPP1O14494 284 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 PTGESO14684 152 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 SERF1AO75920 110 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 MPZL1O95297 269 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 TNFP01375 233 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-HP01893 362 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 MAS1P04201 325 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 ISG15P05161 165 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 PSG2P11465 335 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 PTNP21246 168 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 OR1D2P34982 312 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 OR1D5P58170 312 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 CKS1BP61024 79 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 HSD52Q0P140 79 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 UNC119Q13432 240 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF726P1Q15940 193 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 OR10J3Q5JRS4 329 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 DCST2Q5T1A1 773 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZN92 141 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 FNDC9Q8TBE3 224 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 PSMF1Q92530 271 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 GLYATL1Q969I3 302 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 OR51I2Q9H344 312 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK15Q9H427 330 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 GLIPR2Q9H4G4 154 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 AK3Q9UIJ7 227 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-202ENST00000367364 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.78□□□□□ -1.96
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PTPRC-202ENST00000367364 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0B4J2E0 115 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GX12 115 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-202ENST00000367364 S1PR2O95136 353 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-202ENST00000367364 IGLL1P15814 213 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
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