RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 HIST1H4GQ99525 98 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 NRN1Q9NPD7 142 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SVILO95425 2214 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CACNA1BQ00975 2339 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 P01737 135 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 GLIPR1P48060 266 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CKS1BP61024 79 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 FAM27BQ5VT28 67 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CBLN3Q6UW01 205 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ATOH7Q8N100 152 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 JKAMPQ9P055 326 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 UBE2CO00762 179 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SMIM10Q96HG1 83 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 LRP12Q9Y561 859 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 HBZP02008 142 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PATE4P0C8F1 98 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 IRF3Q14653 427 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CR1LQ2VPA4 569 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.68□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 IGSF23A1L1A6 192 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 HLA-DQA1P01909 254 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CRYGSP22914 178 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 UBALD1Q8TB05 177 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 DPRXA6NFQ7 191 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CD74P04233 296 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 A0A1B0GU03 582 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PGPA6NDG6 321 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 IL4P05112 153 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 LPAR6P43657 344 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 WDR38Q5JTN6 314 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 Q8NFD4 153 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 H7C2G1 150 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 HMGA2P52926 109 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MFAP2P55001 183 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ADIPOQQ15848 244 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 REG4Q9BYZ8 158 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 FAM157CP0CG43 387 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MPV17P39210 176 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C14orf144Q96I85 54 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 RARRES2Q99969 163 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SYNGR2O43760 224 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PITX3O75364 302 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C1QL1O75973 258 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SPTBP11277 2137 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 H3BMH7 237 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SYNGR1O43759 233 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 TSPAN2O60636 221 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 NPPCP23582 126 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 FMODQ06828 376 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 LTBP2Q14767 1821 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 TM4SF5O14894 197 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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