RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 M0R1X1 148 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CORTO00230 105 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CLDN14O95500 239 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 GNG4P50150 75 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 MUC21Q5SSG8 566 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ABHD3Q8WU67 409 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 HES4Q9HCC6 221 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 C3orf80F5H4A9 247 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SPINK2P20155 84 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CCNOP22674 350 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 GCHFRP30047 84 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 OPRK1P41145 380 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 PSG9Q00887 426 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 TBR1Q16650 682 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 FADS6Q8N9I5 356 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SPSB4Q96A44 273 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 OR8B2Q96RD0 313 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.04□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ZNHIT1O43257 154 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SAP30O75446 220 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ZFAND5O76080 213 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 GABRG2P18507 467 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CA7P43166 264 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 PCBD1P61457 104 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ZXDAP98168 799 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CENPWQ5EE01 88 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 LINC00596Q86U02 117 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 RLN3Q8WXF3 142 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 FOXB1Q99853 325 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 HELTA6NFD8 242 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 C15orf62A8K5M9 175 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 MPDU1O75352 247 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 MT-CO2P00403 227 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CELA3BP08861 270 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 NPY1RP25929 384 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SSTR5P35346 364 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 MIC13Q5XKP0 118 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 NINJ1Q92982 152 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 C11orf52Q96A22 123 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 OR4C46A6NHA9 309 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 OR10J4P0C629 311 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 P0C879 139 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 NTF4P34130 210 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SLAQ13239 276 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 ST20Q9HBF5 79 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 FGF21Q9NSA1 209 aa6.03□□□□□ -1.44
CSDE1-201ENST00000261443 USF3Q68DE3 2245 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 C2orf70A6NJV1 201 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 CA6P23280 308 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 IGFBP7Q16270 282 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 TIGITQ495A1 244 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SYT13Q7L8C5 426 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SARAFQ96BY9 339 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 OSTCQ9NRP0 149 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 SDK2Q58EX2 2172 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.02□□□□□ -1.45
CSDE1-201ENST00000261443 LAMA5O15230 3695 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.4 ms