RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	CRYBB3	P26998	211 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	DHRS13	Q6UX07	377 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	S1PR3	Q99500	378 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624		A6NDN8	102 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	STRADB	Q9C0K7	418 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	STPG4	Q8N801	248 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	ITGB1BP1	O14713	200 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	GNG7	O60262	68 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	CCL4	P13236	92 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	NXPH1	P58417	271 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	TMEM50A	O95807	157 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	HAND1	O96004	215 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	PSG1	P11464	419 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	CFP	P27918	469 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	AES	Q08117	197 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	PRSS8	Q16651	343 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	PMS2CL	Q68D20	193 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PXN-222	ENST00000637624	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	IGHM	P01871	453 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	EXT1	Q16394	746 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	LINC01551	Q86U37	167 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	LILRA1	O75019	489 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	CA2	P00918	260 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	OCC1	Q8TAD7	63 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	GNB4	Q9HAV0	340 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FOLR3	P41439	243 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	LIME1	Q9H400	295 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	SYNGR1	O43759	233 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	IFI6	P09912	130 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	SP9	P0CG40	484 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624		Q6ZWC4	215 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ARG2	P78540	354 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ABHD3	Q8WU67	409 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	VCAN	P13611	3396 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ODAM	A1E959	279 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	KCNS1	Q96KK3	526 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	COX11	Q9Y6N1	276 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PR77	199 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	UCP2	P55851	309 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FGF12	P61328	243 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PSG4	Q00888	419 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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