RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 MYOD1P15172 320 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MMD2Q8IY49 270 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 VGLL1Q99990 258 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0U1RQV5 110 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 C7orf71A4D174 169 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 VWC2LB2RUY7 222 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ERGP11308 486 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ASCL4Q6XD76 172 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 IMMP2LQ96T52 175 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 WNT5AP41221 380 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 POU2AF1Q16633 256 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM177Q53S58 311 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RIPPLY3P57055 190 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CKS1BP61024 79 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MMDQ15546 238 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SPSB4Q96A44 273 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF576Q9H609 170 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RNF7Q9UBF6 113 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 KLK13Q9UKR3 277 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CX3CL1P78423 397 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00869P0C866 280 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RHOGP84095 191 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 C8orf44Q96CB5 159 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0G2JLM5 398 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PPBPP02775 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LPAL2Q16609 132 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GPR132Q9UNW8 380 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A8MWV9 139 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CST9LQ9H4G1 147 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TET1Q8NFU7 2136 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PP11 408 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 H0Y8X5 98 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DLL1O00548 723 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS12P56730 875 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OTPQ5XKR4 325 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LOXL4Q96JB6 756 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WWC5 75 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MYOGP15173 224 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GAGE2BQ13066 116 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GAGE2EQ4V326 116 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRRT4C9JH25 899 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFB4O95168 129 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PEX11BO96011 259 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SARGQ9BW04 601 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf172C9J069 976 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ORMDL3Q8N138 153 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LIPT2A6NK58 231 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NXPH1P58417 271 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms