RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TBL1X	O60907	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TOMM40	O96008	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	S100A2	P29034	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	GABRA3	P34903	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PRR4	Q16378	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	BCL2	P10415	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OPRK1	P41145	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392		Q6Q795	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	NRAC	Q8N912	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	CD5L	O43866	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	IFNA7	P01567	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	INSL3	P51460	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF141	Q15928	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392		Q6ZS49	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	CCL13	Q99616	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ATRN	O75882	1429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR10J1	P30954	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	COPZ1	P61923	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TGIF1	Q15583	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	FRZB	Q92765	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392		Q9H3A6	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392		J3QRK9	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	COX7A2L	O14548	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	AMBP	P02760	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TAS2R20	P59543	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	GNA12	Q03113	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	ELOC	Q15369	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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