RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 SERPINE2P07093 398 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 HERV-K104P61576 105 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 FOXL1Q12952 345 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087X0K7 114 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 C17orf51A8MQB3 221 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 J3QR89 54 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 GYPAP02724 150 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 SPINK8P0C7L1 97 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 PAX9P55771 341 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ASCL4Q6XD76 172 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 GNB4Q9HAV0 340 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 TNFP01375 233 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 HLA-DOBP13765 273 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 TM4SF20Q53R12 229 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 Q56UQ5 140 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 PTH2Q96A98 100 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 CD207Q9UJ71 328 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 OTX2P32243 289 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF695Q8IW36 515 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 BORCS7Q96B45 105 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087WX48 190 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 WIPF1O43516 503 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 NRASP01111 189 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 PRTN3P24158 256 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 GNG4P50150 75 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF766Q5HY98 468 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 RCHY1Q96PM5 261 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNK17Q96T54 332 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 COL4A2P08572 1712 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 VWC2LB2RUY7 222 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 NKX2-8O15522 239 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 HBZP02008 142 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 YPEL5P62699 121 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 MBD6Q96DN6 1003 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 CEACAM4O75871 244 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 CER1O95813 267 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 OR1D4P47884 311 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 CARD17Q5XLA6 110 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-217ENST00000510204 NPY1RP25929 384 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 PSG4Q00888 419 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 STPG3Q8N7X2 389 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 DDB2Q92466 427 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNS1Q96KK3 526 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 ADAM20O43506 726 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 FCGR2AP12318 317 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 UQCRFS1P47985 274 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 Q6ZS52 159 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 PIGTQ969N2 578 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A0G2JLM5 398 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 F2RP25116 425 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 TNFRSF4P43489 277 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 TIGITQ495A1 244 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM57BQ71RH2 274 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms