RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC29Q8WV35 223 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM210BQ96KR6 192 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1456Q9P272 454 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFA4P12838 97 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNF1AP20823 631 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAXQ07812 192 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A15Q9Y619 301 aa12.96□□□□□ -0.33
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D1BO14796 132 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRF2P14316 349 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF787Q6DD87 383 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LEAP2Q969E1 77 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLN8Q9UBY8 286 aa12.96□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GU03 582 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCGB1D1O95968 90 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL10A1Q03692 680 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF880Q6PDB4 577 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAPLN4Q86UW8 402 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WFDC8Q8IUA0 241 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMO1P25800 156 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK11-1P61568 191 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF718Q3SXZ3 478 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF497Q6ZNH5 498 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD14BQ96IU4 210 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKIBQ9C010 78 aa12.95□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC18AA5D8T8 446 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEBPZOSA8MTT3 80 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DFFBO76075 338 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00614P0C842 121 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAS1LP35410 378 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBX1P62877 108 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf185Q5T7R7 199 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC18CQ8NCF0 446 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4C12Q96R67 309 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB40CQ96S21 281 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIAL4AQ9Y536 164 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNCP24821 2201 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DVL1O14640 695 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL30P62888 115 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q8NA96 180 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.94□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR13A1Q8NGR1 328 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ2Q96H96 371 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2V2Q96R30 315 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf77C9JDV5 145 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBG1P23258 451 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF726P1Q15940 193 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00596Q86U02 117 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOLPP1Q86YN1 238 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD177Q8N6Q3 437 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS13CQ709C8 3753 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0G2JNJ9 132 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBY3A6NI87 242 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNLZQ5SXM8 178 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF525Q8N782 197 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL22RA2Q969J5 263 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TVP23CQ96ET8 276 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A22Q9H936 323 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q9UFV3 132 aa12.93□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S1PR2O95136 353 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCKARP32238 428 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVFC1-1P60608 527 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMS2P11Q13670 270 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITLN1Q8WWA0 313 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NINJ1Q92982 152 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCFC1P51610 2035 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP9P14780 707 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD33P20138 364 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDDM3BP56851 147 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGFL3Q6UXB1 125 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFRALQ6UXV0 394 aa12.92□□□□□ -0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms